企業已支付費用的退款如何核算？您可以沖銷退款部分的原始費用條目。具體會計分錄如下：

1.企業支付費用時，其會計分錄如下：

借：管理費用/銷售費用等科目，

貸：銀行存款/庫存現金等科目。

2.當企業有退款時，可以作負分錄，如下：

借記：管理費用/銷售費用等科目(負數)，

貸：銀行存款/庫存現金等科目(負)。

根據稅務機關的相關規定：收入項目為勞務報酬、稿酬、特許權使用費的，稅務機關不預征個人所得稅，由付款人履行代扣代繳相關個人所得稅義務，并在發票備注欄統一印制“個人所得稅由付款人依法代扣代繳”字樣。

因此，企業在支付勞動報酬時需要申報代扣代繳個人所得稅。